Study Phenotyping Study: Clonal test of mapping pedigree 3P_A4

Identification

Name
Clonal test of mapping pedigree 3P_A4
Identifier
dXJuOklOUkFFLVVSR0kvc3R1ZHkvQ2hhbXBlbm91eF8zUF9BNA==
Source
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Data link
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Project name
GEN4X
Seasons
2003,2004,2005,2006,2007,2010,2011,2012,2013
Location name
Champenoux

Genotype

Accession number Name Taxon
Q009 Q009 Quercus robur
Q014 Q014 Quercus robur
Q015 Q015 Quercus robur
Q073 Q073 Quercus robur
Q085 Q085 Quercus robur
Q087 Q087 Quercus robur
Q088 Q088 Quercus robur
Q100 Q100 Quercus robur
Q101 Q101 Quercus robur
Q103 Q103 Quercus robur
Q104 Q104 Quercus robur
Q105 Q105 Quercus robur
Q106 Q106 Quercus robur
Q107 Q107 Quercus robur
Q108 Q108 Quercus robur
Q109 Q109 Quercus robur
Q110 Q110 Quercus robur
Q111 Q111 Quercus robur
Q112 Q112 Quercus robur
Q113 Q113 Quercus robur
Q115 Q115 Quercus robur
Q116 Q116 Quercus robur
Q117 Q117 Quercus robur
Q118 Q118 Quercus robur
Q119 Q119 Quercus robur
Q120 Q120 Quercus robur
Q121 Q121 Quercus robur
Q122 Q122 Quercus robur
Q123 Q123 Quercus robur
Q124 Q124 Quercus robur
Q125 Q125 Quercus robur
Q126 Q126 Quercus robur
Q127 Q127 Quercus robur
Q128 Q128 Quercus robur
Q130 Q130 Quercus robur
Q133 Q133 Quercus robur
Q134 Q134 Quercus robur
Q136 Q136 Quercus robur
Q138 Q138 Quercus robur
Q140 Q140 Quercus robur
Q141 Q141 Quercus robur
Q142 Q142 Quercus robur
Q151 Q151 Quercus robur
Q152 Q152 Quercus robur
Q153 Q153 Quercus robur
Q154 Q154 Quercus robur
Q156 Q156 Quercus robur
Q157 Q157 Quercus robur
Q158 Q158 Quercus robur
Q159 Q159 Quercus robur
Q160 Q160 Quercus robur
Q161 Q161 Quercus robur
Q162 Q162 Quercus robur
Q164 Q164 Quercus robur
Q165 Q165 Quercus robur
Q166 Q166 Quercus robur
Q167 Q167 Quercus robur
Q168 Q168 Quercus robur
Q169 Q169 Quercus robur
Q170 Q170 Quercus robur
Q171 Q171 Quercus robur
Q172 Q172 Quercus robur
Q173 Q173 Quercus robur
Q174 Q174 Quercus robur
Q175 Q175 Quercus robur
Q176 Q176 Quercus robur
Q177 Q177 Quercus robur
Q178 Q178 Quercus robur
Q179 Q179 Quercus robur
Q180 Q180 Quercus robur
Q181 Q181 Quercus robur
Q184 Q184 Quercus robur
Q185 Q185 Quercus robur
Q186 Q186 Quercus robur
Q187 Q187 Quercus robur
Q188 Q188 Quercus robur
Q189 Q189 Quercus robur
Q190 Q190 Quercus robur
Q192 Q192 Quercus robur
Q193 Q193 Quercus robur
Q194 Q194 Quercus robur
Q195 Q195 Quercus robur
Q196 Q196 Quercus robur
Q197 Q197 Quercus robur
Q199 Q199 Quercus robur
Q200 Q200 Quercus robur
Q202 Q202 Quercus robur
Q203 Q203 Quercus robur
Q204 Q204 Quercus robur
Q205 Q205 Quercus robur
Q206 Q206 Quercus robur
Q207 Q207 Quercus robur
Q208 Q208 Quercus robur
Q209 Q209 Quercus robur
Q210 Q210 Quercus robur
Q212 Q212 Quercus robur
Q213 Q213 Quercus robur
Q214 Q214 Quercus robur
Q215 Q215 Quercus robur
Q217 Q217 Quercus robur

Variables

Variable ID Variable short name Variable long name Ontology name Trait description
CO_357:0000010 BF_score_BL Broadleaves budflush scoring Woody Plant Ontology Assessment of bud break
CO_357:0000048 HT Tree total height Woody Plant Ontology Total height of the tree, from the ground to the tallest part of the crown
CO_357:0000056 MAR_n6 Marcescence - rating on 6 Woody Plant Ontology Assessment of the marcescence, the retention of dead plant organs that normally are shed such as the withering of leaves without falling off
CO_357:0000076 SEN Senescence Woody Plant Ontology Assessment of the senescence, the growth phase in a plant or plant part (such as a leaf) from full maturity to death
CO_357:0000082 SUR Survival Woody Plant Ontology Assessment of the survival state of the tree

Data Set

Name Type Linked studies identifier
Biogeco Network Outbred pedigree G2 from a controlled cross of two intra-provenance (Landes x Landes) hybrid trees / G2_9.106.3 x 10.159.3 Inbred pedigree classical F2 population resulting from the selfing of a single inter-provenance (Landes x Corsica) hybrid tree / F2_H12 x H12 Clonal test of mapping pedigree 3P_A4 Clonal test of mapping pedigree 3P_A4 Clonal test of mapping pedigree Qs28_Qs21 Clonal test of mapping pedigree 3P_A4 Clonal test of mapping pedigree 27P_Qs28 Clonal test of mapping pedigree 11P_Qs29 Clonal test of mapping pedigree 11P_Qs28 Clonal test of mapping pedigree 11P_11P Clonal test of mapping pedigree 3P_A4

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Role Name Email Institution
Manager & Scientific Kremer ANTOINE antoine.kremer_inrae.fr BIOGECO - Biodiversité Gènes et Communauté